海軍陸戰隊指揮部（陸戰隊指揮部指揮官中將一位、副指揮官少將一位、參謀長少將一位、政戰主任少將一位、副參謀長上校二位、政戰副主任上校二位） 隊部營（2013年11月1日裁併編至戰鬥支援大隊） 隊部連
警衛連（陸戰儀隊，仿自美國海軍陸戰隊無聲操槍排）
輜汽連

兩棲偵搜大隊 特勤中隊 [8]
爆破中隊（詳見：海軍水中爆破大隊 ）

登陸戰車大隊
戰鬥支援大隊（補保大隊、灘岸勤務大隊、通資電大隊合併成立，區分7個中隊） 通電中隊
通資中隊
灘勤中隊
岸勤中隊
衛勤中隊
補保中隊
運輸中隊

海軍陸戰隊陸戰六六旅（旅長一位少將）（下湖營區）
海軍陸戰隊陸戰九九旅（旅長一位少將）
海軍陸戰隊防空警衛群（指揮官一位上校）
烏坵守備大隊（大隊長一位上校）
三軍聯合作戰訓練基地指揮部（指揮官一位少將）

海軍教育訓練暨準則發展指揮部（指揮官一位中將） 海軍陸戰隊學校（校長一位少將）
海軍陸戰隊新兵訓練中心